自“阿尔法折叠2”颠覆蛋白质结构预测以来,人工智能(AI)技术在治疗性抗体设计领域展现出前所未有的应用潜力。
《自然》网站在近日的报道中指出,近年来,多个科研团队利用自主开发的AI工具,辅助设计并成功制备出多种功能各异的治疗性抗体。不过,专家同时提醒,这些抗体的安全性与有效性仍需进一步验证。
抗体药物市场巨大
英国牛津大学旗下《抗体治疗》杂志2022年的分析数据显示,随着数千种新型抗体不断涌现,预计到2028年,全球抗体药物市场年收入将突破4550亿美元。正如诺贝尔奖得主、美国华盛顿大学蛋白质设计专家戴维·贝克所言:“抗体已成为制药领域的硬通货。”
然而,传统抗体开发流程通常面临周期长、成本高、挑战大的困境。候选抗体需经历多轮优化,才能具备理想药物的特性,包括良好的溶解性、高度的特异性以及避免脱靶副作用的安全性。美国麻省理工学院机器学习科学家加布里埃尔·科尔索认为,AI的最新进展正在深刻改变抗体研发范式,使完全通过计算手段设计功能性抗体成为现实。
创新成果快速涌现
《自然》和《科学》网站的报道显示,多个研究团队通过专有AI平台和开源模型,已成功开发出系列功能各异的抗体药物。
去年秋季,总部位于华盛顿州的生物技术公司Absci宣布,设计出首个靶向艾滋病病毒(HIV)保守区域——“火山口区”的特异性抗体。该靶点存在于所有HIV毒株中,意味着此类抗体有望成为广谱抗HIV药物。公司联合创始人肖恩·麦克莱恩透露,团队目前正在开展针对子宫内膜异位症、炎症性肠病乃至脱发治疗的抗体研发。
科尔索团队开发了一种名为BoltzGen的AI模型,专精于蛋白质及多肽结合剂的从头设计,涵盖传统抗体与纳米抗体。该模型采用全原子生成架构,能同步处理蛋白质结构预测与结合剂设计,实现原子级精度的结构调控。纳米抗体是科学家在骆驼、羊驼和鲨鱼体内发现的特殊抗体片段,是目前已知最小的具备完整抗原结合功能的天然分子。
今年10月,科尔索团队称,BoltzGen设计的纳米抗体有望靶向癌症、病毒及细菌感染相关的多种蛋白。研究人员在细胞中表达并测试了15种最具潜力的设计,其中多个抗体显示出强效结合能力。不过这些分子尚未进入疾病模型验证阶段。
其他团队也取得了显著进展。今年2月,贝克团队还宣布,通过AI技术发现了能结合所有流感病毒共有蛋白的广谱抗体,为开发通用流感药物开辟了新途径。该团队同期宣布了能有效中和艰难梭菌毒素的抗体,这种感染在医院环境中常见且致死率高。
Nabla首席执行官瑟吉·比斯瓦斯表示,若能精准调控GPCR活性,就等于掌握了细胞生物学与疾病进程的关键开关。AI系统正从成功案例中学习,快速生成数百个候选调控分子。
丹麦工业大学蛋白质工程师蒂莫西·詹金斯评价道,这轮AI抗体设计浪潮将对临床候选药物的数量与研发效率产生深远影响。
安全验证任重道远
美国加州大学尔湾分校合成生物学家刘畅认为,完全由AI设计的抗体可能很快进入人体试验阶段。上周,美国Genative生物医学公司启动了针对严重哮喘的抗体药物大规模临床试验。该公司运用AI技术对现有抗体进行优化,显著提升了其结合能力、稳定性及其他药理特性。
不过,尽管现有AI工具已能生成高效设计,但其在不同靶点间的表现仍存在差异,且很难准确预测结合强度等关键参数。人们可能需要数年时间,才能建立起完全依赖AI模型的抗体药物生产体系。
(来源:人民网)
编 辑| 杨晓玲
监 审| 赵 莹 赵 丹
监 制| 徐俊峰 郑施恩
总监制|郭瀚群 宋 岩